Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkn2cQ60772 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms