Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr1h2Q60644 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms