Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Satb1Q60611 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms