Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctc1Q5SUQ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctc1Q5SUQ9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms