Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd40Q5SUE8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms