Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtp3Q5QGU6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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