Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCP0

Rnf43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf43Q5NCP0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf43Q5NCP0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf43Q5NCP0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms