Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynaQ5G5D5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms