Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chsy3Q5DTK1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms