Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr1d1Q3UV55 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nr1d1Q3UV55 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms