Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TceancQ3US16 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms