Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shisa3Q3UPR0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shisa3Q3UPR0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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