Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec31aQ3UPL0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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