Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms