Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam83fQ3UKU4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms