Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Usp19Q3UJD6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp19Q3UJD6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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Usp19Q3UJD6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp19Q3UJD6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms