Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm648Q3UJ22 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm648Q3UJ22 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm648Q3UJ22 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gm648Q3UJ22 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gm648Q3UJ22 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gm648Q3UJ22 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gm648Q3UJ22 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Gm648Q3UJ22 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm648Q3UJ22 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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