Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmod2Q3UHZ5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms