Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trafd1Q3UDK1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms