Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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