Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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