Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrn4clQ3TYX2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms