Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TTL0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms