Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctdnep1Q3TP92 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms