Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms