Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc13Q3TIR1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trappc13Q3TIR1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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