Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Itgb8Q0VBD0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms