Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700061G19RikQ08EE8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms