Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssrp1Q08943 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms