Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cnn1Q08091 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Cnn1Q08091 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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