Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col9a2Q07643 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms