Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
NrepQ07475 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms