Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Siah2Q06986 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms