Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Thbs3Q05895 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Thbs3Q05895 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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