Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk18Q04899 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms