Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sox12Q04890 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sox12Q04890 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms