Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox8Q04886 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms