Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tff2Q03404 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms