Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msx2Q03358 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms