Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Thbs2Q03350 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Thbs2Q03350 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms