Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms