Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Zfp39Q02525 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Zfp39Q02525 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms