Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctnnb1Q02248 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms