Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snai1Q02085 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snai1Q02085 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms