Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top2aQ01320 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Top2aQ01320 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms