Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms