Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms