Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms