Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Pitx2P97474 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pitx2P97474 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms