Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vgll3P85442 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms